Sur fond de révolution américaine à la fin du 18e siècle, Assassin's Creed III présente un nouveau héros : Ratohnhaké:ton, qui est en partie d'origine américaine et en partie d'origine anglaise. Il se fait appeler Connor et devient la nouvelle voix de la justice dans la guerre ancestrale entre Assassins et Templiers. Le joueur devient un Assassin dans la guerre pour la liberté et contre la tyrannie dans l'expérience de combat la plus élaborée et la plus fluide de la série. Assassin's Creed III couvre la Révolution américaine et emmène le joueur dans un voyage à travers les frontières vivantes et indomptées, en passant par les villes coloniales animées, jusqu'aux champs de bataille âprement disputés et chaotiques où l'armée continentale de George Washington s'est heurtée à l'impressionnante armée britannique.
Le 18e siècle en Amérique du Nord. Après plus de 20 ans de conflits, les 13 colonies américaines et la Couronne britannique sont au bord d'une guerre en bonne et due forme. Les lignes de bataille sont préparées. Les effusions de sang sont inévitables. Des cendres de ce village en flammes va naître un nouvel Assassin. Fils d'ancêtres mohicans et britanniques, son combat pour la liberté et la justice prendra forme dans la tourmente de la révolution.